Protein pengangkut membran
Protein pengangkut membran (atau sekadar pengangkut) ialah protein membran[1] yang terlibat dalam pergerakan ion, molekul kecil dan makromolekul, seperti protein lain, merentasi membran biologi. Protein pengangkutan ialah protein transmembran integral; yakni ia wujud secara kekal di dalam membran, dan merentangi membran yang merentasi bahan-bahan tersebut. Protein boleh membantu dalam pergerakan bahan melalui resapan berbantu, pengangkutan aktif, osmosis, atau resapan terbalik. Dua jenis protein utama yang terlibat dalam pengangkutan tersebut secara amnya dikategorikan sebagai sama ada saluran atau pembawa. Contoh protein saluran/pembawa termasuk uniporter GLUT 1, saluran natrium dan saluran kalium. Pembawa bahan zat terlarut dan SLC atipikal[2] ialah pengangkut aktif atau berbantu sekunder pada manusia.[3][4] Pengangkut dan saluran membran secara kolektif dikenali sebagai transportom.[5] Transportom mengawal kemasukan dan pengeluaran sel, bukan sahaja ion dan nutrien, tetapi juga ubat-ubatan.
Perbezaan antara saluran dan pembawa
[sunting | sunting sumber]Pembawa tidak terbuka secara serentak kepada kedua-dua persekitaran ekstrasel dan intrasel, yakni sama ada pintu dalamnya atau pintu luarnya terbuka pada satu-satu masa. Sebaliknya, saluran boleh dibuka kepada kedua-dua persekitaran pada masa yang sama, membolehkan molekul meresap tanpa halangan. Pembawa mempunyai tapak pengikatan, tetapi liang dan saluran tidak.[6][7][8] Apabila saluran dibuka, berjuta-juta ion boleh melalui membran sesaat, tetapi hanya 100 hingga 1000 molekul lazimnya melalui molekul pembawa dalam masa yang sama.[9] Setiap protein pembawa direka untuk mengenali hanya satu bahan atau satu kumpulan bahan yang hampir sama. Penyelidikan telah mengaitkan kecacatan dalam protein pembawa tertentu dengan penyakit tertentu.[10]
Pengangkutan aktif
[sunting | sunting sumber]Pengangkutan aktif ialah pergerakan bahan merentasi membran melawan kecerunan kepekatannya. Ini biasanya untuk mengumpul kepekatan tinggi molekul yang diperlukan oleh sel, seperti glukosa atau asid amino. Jika proses itu menggunakan tenaga kimia, seperti adenosina trifosfat (ATP), ia dipanggil sebagai pengangkutan aktif primer. Protein pengangkut membran yang didorong secara langsung oleh hidrolisis ATP dirujuk sebagai pam ATPase.[11] Pam jenis ini secara langsung menghidrolisis eksergonik ATP kepada pergerakan molekul yang tidak menuruti kecerunan kepekatan. Contoh pam ATPase termasuk ATPase jenis P, ATPase jenis V, ATPase jenis F dan kaset pengikat ABC.
Pengangkutan aktif sekunder melibatkan penggunaan kecerunan elektrokimia, dan tidak menggunakan tenaga yang dihasilkan dalam sel.[12] Pengangkutan aktif sekunder biasanya menggunakan jenis protein pembawa, biasanya simporter dan antiporter. Protein simporter menggandingkan pengangkutan satu molekul menuruni kecerunan kepekatannya kepada pengangkutan molekul lain melawan kecerunan kepekatannya, dan kedua-dua molekul meresap ke arah yang sama. Protein antiporter mengangkut satu molekul ke bawah kecerunan kepekatannya untuk mengangkut molekul lain melawan kecerunan kepekatannya, tetapi molekul meresap ke arah yang bertentangan. Oleh kerana simporter dan antiporter terlibat dalam menggandingkan pengangkutan dua molekul, ia biasanya dirujuk sebagai kopengangkut. Tidak seperti protein saluran yang hanya mengangkut bahan melalui membran secara pasif, protein pembawa boleh mengangkut ion dan molekul sama ada secara pasif melalui resapan termudah, atau melalui pengangkutan aktif sekunder.[13] Protein pembawa diperlukan untuk memindahkan zarah dari kawasan kepekatan rendah ke kawasan kepekatan tinggi. Protein pembawa ini mempunyai reseptor yang mengikat kepada molekul tertentu (substrat) yang memerlukan pengangkutan. Molekul atau ion yang akan diangkut (substrat) mesti terlebih dahulu mengikat pada tapak pengikatan pada molekul pembawa, dengan pertalian pengikatan tertentu. Berikutan pengikatan, dan semasa tapak pengikatan menghadap ke arah yang sama, pembawa akan menangkap atau menyekat (mengambil dan mengekalkan) substrat dalam struktur molekulnya dan menyebabkan translokasi dalaman supaya bukaan dalam protein kini menghadap sisi lain membran plasma.[14] Substrat protein pembawa dilepaskan di tapak itu, mengikut pertalian pengikatnya di sana.
Penyebaran yang dipermudahkan
[sunting | sunting sumber]Resapan berbantu ialah laluan molekul atau ion merentasi membran biologi melalui protein pengangkutan tertentu, dan tidak memerlukan input tenaga. Resapan berbantu digunakan terutamanya dalam kes molekul berkutub besar dan ion bercas; sebaik sahaja ion tersebut dilarutkan dalam air, ia tidak boleh meresap dengan bebas merentasi membran sel kerana sifat hidrofobik ekor asid lemak fosfolipid yang membentuk dwilapisan. Jenis protein pembawa yang digunakan dalam resapan berbantu adalah sedikit berbeza berbanding dalam pengangkutan aktif. Ia masih merupakan protein pembawa transmembran, tetapi ini adalah saluran transmembran berpagar, bermakna ia tidak bertranslokasi secara dalaman, dan tidak memerlukan ATP untuk berfungsi. Substrat diambil pada satu sisi pembawa berpagar, dan tanpa menggunakan ATP substrat dilepaskan ke dalam sel. Resapan berbantu tidak memerlukan penggunaan ATP kerana resapan berbantu mengangkut molekul atau ion sepanjang kecerunan kepekatannya seperti dalam resapan ringkas.[15]
Osmosis
[sunting | sunting sumber]Osmosis ialah resapan pasif molekul air merentasi membran sel dari kawasan berkepekatan tinggi ke kawasan berkepekatan rendah. Oleh kerana osmosis ialah proses pasif seperti resapan berbantu dan ringkas, ia tidak memerlukan penggunaan ATP. Osmosis adalah penting dalam mengawal keseimbangan air dan garam dalam sel. Oleh itu, ia memainkan peranan penting dalam mengekalkan homeostasis.[16] Akuaporin ialah protein membran integral yang membolehkan laluan pantas air dan gliserol melalui membran. Monomer akuaporin terdiri daripada enam domain alfa-heliks transmembran, dan monomer ini boleh berkumpul untuk membentuk protein akuaporin. Memandangkan empat daripada monomer ini bersatu untuk membentuk protein akuaporin, ia dikenali sebagai homotetramer, bermakna ia terdiri daripada empat subunit yang sama.[17][18] Semua akuaporin ialah protein integral membran tetramer, dan molekul air melalui setiap saluran monomer individu berbanding semua empat saluran. Memandangkan akuaporin ialah saluran transmembran bagi resapan air, saluran yang membentuk akuaporin lazimnya dialas dengan rantai sisi hidrofilik untuk membolehkan air melaluinya.
Resapan songsang
[sunting | sunting sumber]Pengangkutan songsang, atau pembalikan pengangkut, ialah fenomena di mana substrat protein pengangkutan membran dialihkan ke arah yang bertentangan dengan pergerakan biasa mereka oleh pengangkut.[19][20][21][22][23] Pembalikan transporter biasanya berlaku apabila protein pengangkutan membran difosforilkan oleh kinase protein tertentu, iaitu enzim yang menambah kumpulan fosfat kepada protein.[19][20]
Jenis
[sunting | sunting sumber](Dikumpulkan mengikut kategori pangkalan data Pengelasan Pengangkut)
1: Saluran atau liang
[sunting | sunting sumber]- Saluran protein α-heliks seperti saluran ion berpagaran voltan (VIC), saluran ion berpagaran ligan (LGIC)
- Porin balang β seperti akuaporin
- Toksin pembentuk saluran, termasuk kolisin, toksin difteria, dan lain-lain
- Saluran yang disintesis secara bukan ribosom seperti gramisidin
- Holin yang berfungsi dalam eksport enzim yang mencerna dinding sel bakteria dalam langkah awal lisis sel.
- Protein liang
2: Pengangkut dipandu potensi elektrokimia
[sunting | sunting sumber]Juga dinamakan sebagai protein pembawa atau pembawa sekunder.
- 2.A: Porter (uniporter, simporter, antiporter), SLC.[4]
- Pengangkut asid amino penguja (EAATs)
- EAAT1
- EAAT2
- EAAT3
- EAAT4
- EAAT5
- Pengangkut glukosa
- Pengangkut monoamina, termasuk:
- Pengangkut dopamina (DAT)
- Pengangkut norepinefrina (NET)
- Pengangkut serotonin (SERT)
- Pengangkut monoamina vesikel (VMAT)
- Translokator nukleotida adenina (ANT)
- Pengangkut asid amino penguja (EAATs)
- 2.B: Porter sintesis bukan ribosom, seperti:
- 2.C: Penjana tenaga dipandu kecerunan ion
3: Protein pengangkutan membran
[sunting | sunting sumber]- 3.A: Pengangkut didorong hidrolisis ikatan PP:
- Pengangkut kaset pengikat ATP (pengangkut ABC), seperti MDR, CFTR
- ATPase jenis V ; ( "V" berkaitan dengan vakuol).
- ATPase jenis P ; ( "P" berkaitan dengan fosforilasi), seperti:
- ATPase jenis F ; ("F" berkaitan dengan faktor), termasuk: ATP sintase mitokondria, ATP sintase kloroplas 1
- 3.B: Pengangkut dipandu penyahkarboksilan
- 3.C: Pengangkut dipandu pemindahan metil
- 3.D: Pengangkut dipandu pengoksidaan
- 3.E: Pengangkut dipandu penyerapan cahaya, seperti rodopsin
4: Translokator kumpulan
[sunting | sunting sumber]Translokator kumpulan menyediakan mekanisme khas untuk fosforilasi gula kerana ia diangkut ke dalam bakteria (translokasi kumpulan PEP)
5: Pembawa elektron
[sunting | sunting sumber]Pembawa pemindahan elektron transmembran dalam membran termasuk pembawa dua elektron, seperti oksidoreduktase ikatan disulfida (DsbB dan DsbD dalam E. coli) serta pembawa satu elektron seperti NADPH oksidase. Selalunya, protein redoks ini tidak dianggap sebagai protein pengangkutan.
Patologi
[sunting | sunting sumber]Sebilangan penyakit diwarisi melibatkan kecacatan dalam protein pembawa dalam bahan atau kumpulan sel tertentu. Sisteinuria (sisteina dalam air kencing dan pundi kencing) ialah sejenis penyakit yang melibatkan protein pembawa sistein yang rosak dalam membran sel buah pinggang. Sistem pengangkutan ini biasanya mengeluarkan sisteina daripada cecair yang ditakdirkan untuk menjadi air kencing dan mengembalikan asid amino penting ini ke dalam darah. Apabila pembawa ini tidak berfungsi, sejumlah besar sistein kekal dalam air kencing, di mana ia agak tidak larut dan cenderung untuk memendakan. Ini adalah salah satu punca terbitnya batuan karang.[24] Beberapa protein pembawa vitamin telah ditunjukkan diekspresi secara berlebihan dalam kalangan pesakit dengan penyakit malignan. Sebagai contoh, tahap protein pembawa riboflavin (RCP) telah ditunjukkan meningkat dengan ketara pada penghidap kanser payudara.[25]
Rujukan
[sunting | sunting sumber]- ^ Membrane+transport+proteins dalam Tajuk Subjek Perubatan (MeSH) di Perpustakaan Perubatan Negara AS
- ^ Perland, Emelie; Bagchi, Sonchita; Klaesson, Axel; Fredriksson, Robert (2017-09-01). "Characteristics of 29 novel atypical solute carriers of major facilitator superfamily type: evolutionary conservation, predicted structure and neuronal co-expression". Open Biology (dalam bahasa Inggeris). 7 (9): 170142. doi:10.1098/rsob.170142. ISSN 2046-2441. PMC 5627054. PMID 28878041.
- ^ Hediger, Matthias A.; Romero, Michael F.; Peng, Ji-Bin; Rolfs, Andreas; Takanaga, Hitomi; Bruford, Elspeth A. (February 2004). "The ABCs of solute carriers: physiological, pathological and therapeutic implications of human membrane transport proteinsIntroduction". Pflügers Archiv: European Journal of Physiology. 447 (5): 465–468. doi:10.1007/s00424-003-1192-y. ISSN 0031-6768. PMID 14624363.
- ^ a b Perland, Emelie; Fredriksson, Robert (March 2017). "Classification Systems of Secondary Active Transporters". Trends in Pharmacological Sciences. 38 (3): 305–315. doi:10.1016/j.tips.2016.11.008. ISSN 1873-3735. PMID 27939446.
- ^ Huang, Y; Anderle, P; Bussey, KJ; Barbacioru, C; Shankavaram, U; Dai, Z; Reinhold, WC; Papp, A; Weinstein, JN (15 June 2004). "Membrane transporters and channels: role of the transportome in cancer chemosensitivity and chemoresistance". Cancer Research. 64 (12): 4294–301. doi:10.1158/0008-5472.CAN-03-3884. PMID 15205344.
- ^ Sadava, David, et al. Life, the Science of Biology, 9th Edition. Macmillan Publishers, 2009. ISBN 1-4292-1962-9. p. 119.
- ^ Cooper, Geoffrey (2009). The Cell: A Molecular Approach. Washington, DC: ASM Press. m/s. 62. ISBN 9780878933006.
- ^ Thompson, Liz A. Passing the North Carolina End of Course Test for Biology. American Book Company, Inc. 2007. ISBN 1-59807-139-4. p. 97.
- ^ Assmann, Sarah (2015). "Solute Transport". Dalam Taiz, Lincoln; Zeiger, Edward (penyunting). Plant Physiology and Development. Sinauer. m/s. 151.
- ^ Sadava, David, Et al. Life, the Science of Biology, 9th Edition. Macmillan Publishers, 2009. ISBN 1-4292-1962-9. p. 119.
- ^ Rappas, Mathieu; Niwa, Hajime; Zhang, Xiaodong (2004). "Mechanisms of ATPases--a multi-disciplinary approach". Current Protein & Peptide Science. 5 (2): 89–105. doi:10.2174/1389203043486874. ISSN 1389-2037. PMID 15078220.
- ^ Ashley, Ruth. Hann, Gary. Han, Seong S. Cell Biology. New Age International Publishers. ISBN 8122413978. p. 113.
- ^ Taiz, Lincoln. Zeigler, Eduardo. Plant Physiology and Development. Sinauer Associates, 2015. ISBN 978-1-60535-255-8. pp. 151.
- ^ Kent, Michael. Advanced Biology. Oxford University Press US, 2000. ISBN 0-19-914195-9. pp. 157–158.
- ^ Cooper, Geoffrey M. (2000), "Transport of Small Molecules", The Cell: A Molecular Approach. 2nd edition (dalam bahasa Inggeris), Sinauer Associates, dicapai pada 2023-09-08
- ^ Lord, R (1999). "Osmosis, osmometry, and osmoregulation". Postgraduate Medical Journal. 75 (880): 67–73. doi:10.1136/pgmj.75.880.67. ISSN 0032-5473. PMC 1741142. PMID 10448464.
- ^ Verkman, A.S. (2013-01-21). "Aquaporins". Current Biology. 23 (2): R52–R55. doi:10.1016/j.cub.2012.11.025. ISSN 0960-9822. PMC 3590904. PMID 23347934.
- ^ Verkman, A. S.; Mitra, Alok K. (2000-01-01). "Structure and function of aquaporin water channels". American Journal of Physiology-Renal Physiology (dalam bahasa Inggeris). 278 (1): F13–F28. doi:10.1152/ajprenal.2000.278.1.F13. ISSN 1931-857X. PMID 10644652.
- ^ a b "Kinase-dependent Regulation of Monoamine Neurotransmitter Transporters". Pharmacol. Rev. 68 (4): 888–953. October 2016. doi:10.1124/pr.115.012260. PMC 5050440. PMID 27591044.
- ^ a b "The emerging role of trace amine-associated receptor 1 in the functional regulation of monoamine transporters and dopaminergic activity". Journal of Neurochemistry. 116 (2): 164–176. January 2011. doi:10.1111/j.1471-4159.2010.07109.x. PMC 3005101. PMID 21073468.
- ^ "The role of zinc ions in reverse transport mediated by monoamine transporters". The Journal of Biological Chemistry. 277 (24): 21505–13. 2002. doi:10.1074/jbc.M112265200. PMID 11940571.
- ^ "A closer look at amphetamine-induced reverse transport and trafficking of the dopamine and norepinephrine transporters". Molecular Neurobiology. 39 (2): 73–80. 2009. doi:10.1007/s12035-009-8053-4. PMC 2729543. PMID 19199083.
- ^ "Glutamate release from platelets: exocytosis versus glutamate transporter reversal". The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 45 (11): 2585–2595. November 2013. doi:10.1016/j.biocel.2013.08.004. PMID 23994539.
- ^ Sherwood, Lauralee. 7th Edition. Human Physiology. From Cells to Systems. Cengage Learning, 2008. p. 67
- ^ Rao, PN, Levine, E et al. Elevation of Serum Riboflavin Carrier Protein in Breast Cancer. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. Volume 8 No 11. pp. 985–990